غلبه فضای سیاسی و جناحی بر فضای علمی و فرهنگی جهاددانشگاهی موجب شد، نقدها به این مجموعه زیاد شود. این اتفاقات مصادف با زمانی شد که طرح ادغام جهاددانشگاهی در وزارتخانه های علوم و بهداشت همچون طرح ادغام جهادسازندگی در وزارت کشاورزی مطرح بود، اما در نهایت به سرانجام نرسید.

تفاهم‌نامه ایجاد کنسرسیوم مرکز توسعه فناوری مواد پیشرفته با حضور استاندار یزد و مدیران شرکت‌های دانش‌بنیان امضا شد. این همکاری پنج‌ساله با هدف توسعه پژوهش‌های کاربردی و تجاری‌سازی ایده‌های نوین در حوزه مواد پیشرفته منعقد گردید.